1. 證券交易所所在地：滬市位于上海，深市位于深圳。

2. 市場(chǎng)板塊不同：滬市只有主板和B股，而深市則有主板、中小板、創(chuàng)業(yè)板和B股。

3. 股票代碼也有所不同：滬市的主板股票代碼以60開(kāi)頭，B股以900開(kāi)頭；而深市主板股票代碼以000開(kāi)頭，中小板以002開(kāi)頭，創(chuàng)業(yè)板以300開(kāi)頭，B股以200開(kāi)頭。

4. B股標(biāo)價(jià)模式不同：滬市B股以美元競(jìng)價(jià)，而深市B股以港幣競(jìng)價(jià)。

5. 交易制度不同：雖然兩個(gè)市場(chǎng)的基本交易規(guī)則是一致的，但是在交易結(jié)束最后3分鐘（14:57-15:00），交易制度有所不同。滬市是采用連續(xù)競(jìng)價(jià)，而深市則是采用集合競(jìng)價(jià)。

6. 托管方式也有所不同：滬市采用指定交易制度，即在設(shè)置證券賬戶時(shí)需要先選擇一家證券公司股民可以在任何地方買賣股票，賬戶轉(zhuǎn)托之間無(wú)需受限制。